1964, 21 de septiembre: El IESE lanza su programa máster, a cuyo comité directivo pertenecen miembros de la Business School de la Universidad de Harvard.
1965: Comienza sus actividades el Instituto de Ciencias de la Educación (ICE), reconocido oficialmente en 1970. Actualmente está integrado en el departamento de Educación.
1966: Francisco Ponz Piedrafita toma posesión como rector de la Universidad de Navarra. Se pone en marcha el Instituto de Lengua y Cultura Españolas.
1966, 8 de diciembre: En la festividad de la Inmaculada, y con la advocación de ‘Madre del Amor Hermoso’, la imagen de Santa María comienza a presidir desde la ermita el quehacer universitario. La obra escultórica es del profesor italiano Emilio Sciancalepore y cuenta con la bendición del Papa Pablo VI.