La Facultad de Ciencias de la Universidad de Navarra coordina la gestión del Doctorado en Química, un programa que compete principalmente al departamento de Química y Edafología.

Los profesores de este departamento son los que en su gran mayoría dirigen y desarrollan las diferentes líneas de investigación en las que se encuadran la mayor parte de los Trabajos de Investigación del máster en Química Aplicada a la Investigación y la Industria y las tesis doctorales realizadas en el ámbito de este programa de doctorado.