En relación con las implicaciones canónicas, el Prof. Fuentes hizo un repaso de las consecuencias que se pueden originar en las siguientes materias: en el registro de bautismo (considerando en este punto la trascendencia de la sentencia del Tribunal Supremo de septiembre de 2008); en lo que se refiere al matrimonio; consecuencias canónicas de la filiación y adopción en estos casos; consecuencias en relación con el sacremento del Orden y en relación con la vida consagrada; y, por último consecuencias en relación con diversos actos eclesiales (padrinos del bautismo, oficios, participación en instituciones eclesiásticas y asociaciones).

Durante el diálogo el Prof. Tejero incidió en la importancia de una correcta situación del transexualismo en la antropología. El Prof. Miras destacó la necesidad de no confundir el tratamiento jurídico de la cuestión con las consideraciones morales o pastorales, y recordó que nadie es ajeno o incompatible con la preocupación pastoral de la Iglesia. El Prof. Viana consideró las múltiples implicaciones canónicas de las nuevas situaciones familiares, y explicó con algunos ejemplos la necesidad de distinguir y de no utilizar de modo genérico y universal la categoría de "familia irregular".