La Colección de Manuales, que comenzó en 1994, ha publicado hasta el momento los siguientes volúmenes:
Juan Luis LORDA, Antropología Teológica, 560 pp., EUNSA, 2009.
Augusto SARMIENTO - Tomás TRIGO - Enrique MOLINA, Moral de la persona, 455 pp., EUNSA, 2006.
Domingo RAMOS-LISSÓN, Patrología, 525 pp., EUNSA, 2005.
Javier SESÉ, Historia de la Espiritualidad, 304 pp. EUNSA, 2005.
Daniel CENALMOR - Jorge MIRAS, El Derecho de la Iglesia. Curso básico de Derecho Canónico, 576 pp. EUNSA, 2004.
José J. ALVIAR, Escatologia, 365 pp. EUNSA, 2004.
Jaime PUJOL - Francisco DOMINGO - Anastasio GIL - Mateo BLANCO, Introducción a la pedagogía de la fe, 448 pp. EUNSA, 2001.
José Antonio ÍÑIGUEZ HERRERO, Arqueología cristiana, 272 pp. EUNSA, 2000.
Evencio CÓFRECES - Ramón GARCÍA DE HARO, Teología moral fundamental. Fundamentos de la vida cristiana, 608 pp. EUNSA, 1998.
José MORALES, Introducción a la teología, 352 pp. EUNSA, 1998.
César IZQUIERDO, Teología fundamental, 584 pp. EUNSA, 1998.
Lucas F. MATEO-SECO, Dios Uno y Trino, volumen doble, 784 pp. EUNSA, 1998.
Augusto SARMIENTO, El matrimonio cristiano, 484 pp. EUNSA, 1997 (2ª edic. 2001, 486 pp).
José Antonio ABAD, La celebración del misterio cristiano, volumen doble, 672 pp. EUNSA, 1996 (2ª edic. 2000, 728 pp).
Juan Luis BASTERO, María, Madre del Redentor, 333 pp. EUNSA, 1995.
José MORALES, El misterio de la Creación, 336 pp. EUNSA, 1994 (2ª edic. 2000, 360 pp).
Fernando OCÁRIZ - Lucas F. MATEO-SECO - José Antonio RIESTRA, El misterio de Jesucristo (lecciones de Cristología y Soteriología), 452 pp. EUNSA, 1991 (3.ª edic. 2004, 489 pp).
Actualmente se están elaborando otros manuales que tratan de las diversas áreas de estudio de la Sagrada Escritura, Teología Fundamental y Dogmática, Eclesiología, Teología Moral y Espiritual e Historia de la Iglesia y de la Teología. Aparecerán de forma sucesiva en los próximos años.