La propia estructura física del área (distribuida en cuatro edificios consecutivos) no ha hecho sino reforzar esta realidad, otorgando notables resultados tanto en el campo docente como en el investigador.
Los años 70 y mitad de los 80 fueron los de la maduración de un proyecto universitario que tuvo como Decano al catedrático de Fisiología Jesús Larralde. Durante esos cursos se fue incrementando progresivamente el número de alumnos de la Facultad hasta superar el millar entre la Licenciatura y el Tercer Ciclo.
Al igual que el resto de las facultades españolas, los años 90 han sido los de la adaptación a los nuevos planes de estudio, la potenciación del Tercer Ciclo, la Formación a distancia y el reforzamiento de los acuerdos con la industria farmacéutica. Este periodo se inició con Mª Pilar Fernández Otero, catedrática de Fisiología, como Decana, cargo que siguió desde 1994 hasta el 2004 con la catedrática de Farmacología Edurne Cenarruzabeitia. Actualmente es continuado por Iciar Astiasarán.
El diseño de los nuevos Planes de Estudios se orientó a una sólida formación académica que tuviese especial énfasis en las áreas tecnológica, bioquímica, farmacológica y clínico-sanitaria, esta última en colaboración con el Servicio de Farmacia de la Clínica Universitaria (entidad a la que estamos estrechamente relacionados) y con nuestro Centro Galénico, que cumple las "Normas de Correcta Fabricación de calidad de medicamentos" de la Unión Europea (calidad, seguridad farmacéutica, medio ambiente), en el que los alumnos también realizan prácticas.
Esta etapa ha visto también el nacimiento de dos líneas estratégicas de investigación en la Facultad de Farmacia: una en el área galénica ("Nuevas formas farmacéuticas vectores de medicamentos") y otra en el área nutricional ("Nutrición, obesidad y salud") que cuentan con una veintena de investigadores.
Todo ello sin olvidar que una de las mayores novedades de esta etapa ha sido la progresiva incorporación de las nuevas tecnologías, sobre todo en la formación on line para profesionales, que en nuestro caso se ha orientado esencialmente al campo de la Nutrición.
En lo que atañe a las Relaciones Internacionales, nuestra Facultad acoge y envía desde su creación a alumnos de los Programas Erasmus, Sócrates y Leonardo y mantiene acuerdos de colaboración e intercambio académico y docente con países de Europa, América y Asia.
En el año 2000, la Facultad de Farmacia fue valorada dentro del I Plan Nacional de Evaluación de la Calidad las Universidades españolas del Ministerio de Educación. En dicho estudio se señaló que la Facultad de Farmacia de la Universidad de Navarra: "Destaca por el alto grado de profesionalidad, dedicación y motivación del profesorado, que incide directamente en la excelencia de su calidad docente e investigadora en pruebas de valoración objetiva". La duración media de los estudios es de 5,3 años con una tasa de éxito del 97% de los alumnos y todos los integrantes del Claustro académico son doctores.
En la convocatoria 2003, la Facultad de Farmacia es el primer centro universitario en España acreditado por el Ministerio de Educación y Cultura para impartir la nueva especialización FIR en Farmacia Industrial y Galénica.
En el curso 2003-04 se inicia la doble titulación en Farmacia y Nutrición Humana y Dietética, que permitirá a aquellos alumnos que la cursen obtener en seis años ambas carreras. También se crea en ese año el Instituto de Ciencias de la Alimentación que imparte un titulo propio en Nutrición.
