La Facultad cuenta con un equipo de investigadores de distintos departamentos capaces de dar una respuesta eficaz y profesional a los problemas ambientales actuales.
Investigadores de la Universidad participan en los programas internacionales del Convenio de Ginebra (LRTAP) o en la Infraestructura Global de Información sobre Biodiversidad (GBIF).
Mantiene acuerdos con universidades y centros de investigación de prestigio, como la Universidad de California-Berkeley para el estudio de paisajes mediterráneos o con el CSIC (Unidad Asociada al CSIC, a través de la Estación Experimental de Aula Dei ,EEAD-CSIC y del Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino ,ICVV)...
La Facultad de Ciencias participa en el proyecto PRODEMA , el Observatorio Territorial de Navarra, el Consejo Navarro del Medio Ambiente (Gobierno de Navarra) o la Agenda 21 (Ayuntamiento de Pamplona).

