Aunque SERIE ZOOLOGICA acepta trabajos diversos sobre Fauna, Ecología y Sistemática, su ámbito particular son los trabajos sistemáticos o ecológicos cuyo ámbito sea principalmente Navarra y las regiones limítrofes; las monografías taxonómicas generales que por su extensión no son publicables en otras revistas especializadas, y series de artículos sobre fauna y ecología relacionados entre sí.

La edición de SERIE ZOOLOGICA es desde 2005 dual papel/electrónica. Los trabajos pueden ser remitidos en español o inglés y son revisados por especialistas antes de su aceptación. La publicación es bilingüe.