La labor investigadora, de fundamental importancia para el Departamento de Física y Matemática Aplicada, se enmarca en su mayoría dentro del tema "Sistemas Complejos". Varias especialidades se conjugan en estos estudios: la Física de fluidos, la materia blanda, la Dinámica de sistemas no lineales, formación de estructuras a diversas escalas, la Teoría de bifurcaciones, los estudios de Caos espacio-temporal o la Ciencia de la complejidad. Otras lineas de investigación incluyen los grupos topológicos, las redes de reacciones químicas y el "soft computing".

Aunque la investigación se centra en la comprensión de aspectos básicos, se trabaja teniendo en mente la conexión con aplicaciones industriales y transfiriendo los resultados, en aquellos casos en que es posible, hacia el sector productivo.

En su transcurso se promueve la formación de doctorandos, la movilidad de sus investigadores, la presencia de investigadores visitantes.

Líneas de Investigación

• Biofísica del corazón. Investigadores: Jean Bragard, Jorge Elorza. Doctorando: Ana Simic.

• Complejidad espacio-temporal: formación, sincronización y control de estructuras fuera del equilibrio: Héctor L. Mancini.

• Grupos Topológicos. Investigadores: María Jesús Chasco, Sergio Ardanza-Trevijano.

• Magnetohidrodinámica y BioMHD. Investigadores: Javier Burguete, Wenceslao Gonzalez. Doctorando: Miguel López.

• Materiales mesoestructurados y materia blanda. Investigadores: Wenceslao González-Viñas. Doctorandos:  Moorthi Pichumani, José Guadarrama.

• Medios granulares. Investigadores: Ángel Garcimartín, Raúl Cruz Hidalgo, Diego Maza, Iker Zuriguel, Álvaro Janda. Doctorandos: Manuel Acevedo, Jose de la Cruz, Celia Lozano.

• Redes de Reacciones Químicas. Investigador: Antonio Peláez.

• Soft Computing. Investigador: Jorge Elorza