El Doctorado es un periodo formativo basado, sobre todo, en la investigación crítica de un tema científico. Según la normativa oficial «Las enseñanzas de Doctorado tienen como finalidad la formación avanzada del estudiante en las técnicas de investigación».
El Departamento de Filología de la Universidad de Navarra tiene tres programas de doctorado:
Para los trámites de Admisión al Doctorado los candidatos deben dirigirse a las Oficinas Generales de la Universidad de Navarra.