El Departamento de Derecho Canónico y Derecho Eclesiástico del Estado se ocupa de la docencia e investigación de estas dos asignaturas en la Facultad de Derecho.

El Profesor Pedro Lombardía, que fue el primer Catedrático de esta disciplina en la Facultad, y maestro de reconocido prestigio a nivel mundial (fallecido en 1986), solía insistir en que el estudio del Derecho Canónico en su conjunto «es más formativo para el alumno que el de algunas instituciones aisladas, por mucha que sea su importancia doctrinal o práctica». Por esta razón, se trata de presentar, a lo largo del Curso, las fundamentales líneas del sistema de Derecho Canónico, si bien se presta particular atención al Derecho matrimonial canónico.

Y en cuanto al Derecho Eclesiástico del Estado, se estudia e investiga en todas aquellas cuestiones -teóricas y prácticas- relativas a este sector del ordenamiento jurídico estatal que regula la proyección social del fenómeno religioso -la dimensión religiosa de la vida del hombre- en el ámbito civil. La personalidad jurídica de las entidades religiosas, el patrimonio histórico-religioso, la enseñanza, el matrimonio, las cuestiones patrimoniales, financieras y tributarias, la objeción de conciencia, por citar sólo unas determinadas materias, constituyen un amplio espectro que es objeto del Derecho Eclesiástico.

El Departamento de Derecho Canónico y Derecho Eclesiástico del Estado, de la Facultad de Derecho, mantiene relación y conexiones permanentes -de las que, sin duda alguna, se beneficia extraordinariamente-, con las demás instituciones, nacionales e internacionales (tanto de Europa, como de América, especialmente), dedicadas a la docencia e investigación en estas materias; pero, de modo particular, con la Facultad de Derecho Canónico y con el Instituto Martín de Azpilcueta, de la Universidad de Navarra.